Flateyrarkirkja er í Holtsprestakalli í Ísafjarðarprófastsdæmi. Flateyri er kauptún við norðanverðan .
Kirkjan var byggð úr steinsteypu og vígð 1936 og henni er þjónað frá Holti. Brynjólfur Þórðarson, listmálari, málaði altaristöfluna og Leifur Breiðfjörð gerði fimm steinda glugga í kirkjuna. Vínkanna er úr kristal og aðrir merkir gripir eru kaleikur og patina, ljósakróna og ljósastjaki.
Við kirkjuna var reistur minningarsteinn um þá sem fórust í snjóflóðunum 1995.
